可能的原因有很多：
鹅口疮或者急性咽喉炎：宝宝喝奶会有疼痛感，因此而拒绝吃奶，造成食量减少、体重增长缓慢，抵抗力降低，使病菌肆意增殖形成恶性循环。

牛奶过敏：宝宝对牛奶中的蛋白过敏。也就是宝宝体内的免疫系统对牛奶蛋白的过度反应，从而造成的食物过敏。

乳糖不耐受：宝宝的乳糖酶不足，无法把乳糖水解为单糖，从而会导致宝宝乳糖不耐受，出现腹痛、腹泻或者腹胀，尤其是宝宝腹泻后容易诱发继发性乳糖不耐受。

中耳炎：孩子可以表现为发热、甚至高热、惊厥，常常伴随恶心、呕吐、腹泻等消化道症状。常见表现有皮疹，呕吐和（或）腹泻。当过敏影响到呼吸系统时还可能会出现慢性咳嗽、喘鸣或呼吸困难等。

急性呼吸道感染：鼻塞，婴儿吸奶时无法换气，也会厌奶。

急性肠胃炎或者尿路感染造成腹痛、发烧，婴儿会哭闹不安。

最严重的厌奶状况，则是患有败血症的婴儿。

如果发现宝宝除了厌食，还有腹胀、呕吐、发烧或呼吸急促、活力不佳等情况，就应立即就医。

另外还有生理性厌奶期，4-6个月以后，婴儿的生理发育及感官功能愈来愈成熟，开始对周遭的环境产生好奇并喜欢探索，自然就容易对“吃”分心，这是生理性厌奶的主要原因。另外，宝宝添加辅食后，宝宝在吃了与母乳不同的多样化食物之后，很可能会“喜新厌旧”，变得不再只钟情于“奶水”这种单一口味的东西。甚至觉得吸拇指都比喝奶好玩，所以也会有厌奶的现象产生。